過去要搭乘南迴線的區間車,僅有在清晨時段,從枋寮(3501次)及台東(3514次)方向各對開一班車。南迴線非電氣化時期,除了中午時段以柴頭牽聯的普通車外,早晨的區間車則是以復興號車廂編組擔任,實際上算是用對號車的規格行駛區間車的等級。花東線、南迴線陸續完成電氣化工程後,EMU電聯車可以直接駛入,無須再以DMU或是柴頭牽聯的車廂擔任區間車的角色。而區間車編組彈性的特色,在離峰時間搭乘人數懸殊的花東線,1組4節車廂的EMU顯得綽綽有餘,多數時候顯得格外空曠。至於南迴線的區間車,依然使用柴頭牽聯的復興號車廂編組擔任,或許有一天還是會被EMU電聯車取代。